Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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