Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms