Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NischQ80TM9 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Uggt1-201ENSMUST00000046875 9033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms