Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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