Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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