Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms