Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tdrd5Q5VCS6 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tdrd5Q5VCS6 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms