Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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