Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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