Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Hdgfl1Q2VPR5 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdgfl1Q2VPR5 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Hdgfl1Q2VPR5 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Hdgfl1Q2VPR5 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Hdgfl1Q2VPR5 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Hdgfl1Q2VPR5 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Hdgfl1Q2VPR5 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hdgfl1Q2VPR5 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hdgfl1Q2VPR5 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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