Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc162pQ0VG85 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc162pQ0VG85 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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