Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SbdsP70122 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms