Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm4178-201ENSMUST00000218307 649 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Ttc29-201ENSMUST00000049395 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VdrP48281 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms