Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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