Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
RxraP28700 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
RxraP28700 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
RxraP28700 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
RxraP28700 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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