Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms