Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
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Ube3bQ9ES34 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
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Ube3bQ9ES34 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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Ube3bQ9ES34 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Ube3bQ9ES34 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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Ube3bQ9ES34 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
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Ube3bQ9ES34 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Ube3bQ9ES34 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Ube3bQ9ES34 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Ube3bQ9ES34 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Ube3bQ9ES34 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Ube3bQ9ES34 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Ube3bQ9ES34 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Ube3bQ9ES34 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Ube3bQ9ES34 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube3bQ9ES34 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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