Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Atg3Q9CPX6 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Atg3Q9CPX6 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms