Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Pcsk9Q80W65 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Pcsk9Q80W65 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Pcsk9Q80W65 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Pcsk9Q80W65 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Pcsk9Q80W65 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Pcsk9Q80W65 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Pcsk9Q80W65 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Pcsk9Q80W65 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Pcsk9Q80W65 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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