Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms