Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms