Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Pkp1P97350 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms