Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Defa6P50704 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Defa6P50704 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms