Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm25442-201ENSMUST00000177270 92 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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VdrP48281 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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VdrP48281 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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VdrP48281 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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VdrP48281 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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VdrP48281 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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VdrP48281 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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VdrP48281 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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VdrP48281 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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