Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprkP35822 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprkP35822 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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