Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Myo5c-201ENSMUST00000036555 6727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Pappa2-202ENSMUST00000159861 9518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprmP28828 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
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