Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RxraP28700 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
RxraP28700 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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