Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms