Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

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Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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PtprbB2RU80 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PtprbB2RU80 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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PtprbB2RU80 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PtprbB2RU80 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PtprbB2RU80 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PtprbB2RU80 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PtprbB2RU80 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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PtprbB2RU80 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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