Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms