Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Znf518bB2RRE4 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Znf518bB2RRE4 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Znf518bB2RRE4 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms