Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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