Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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