Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Ndufa7-201ENSMUST00000048249 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Calcr-201ENSMUST00000075644 3763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm3147-202ENSMUST00000201071 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 A430089I19Rik-201ENSMUST00000097479 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdac5Q9Z2V6 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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