Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ubl3Q9Z2M6 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms