Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnft1Q9DCN7 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms