Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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Cldn22Q9D7U6 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Cldn22Q9D7U6 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Cldn22Q9D7U6 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Cldn22Q9D7U6 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Cldn22Q9D7U6 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.6 ms