Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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