Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms