Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trappc2Q9CQP2 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms