Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl11Q9CQF0 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms