Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms