Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms