Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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