Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxa13Q62424 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms