Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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