Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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