Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms