Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms