Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms